1. Ποιότητα αέρα: Λόγω του μικρού χώρου του ξενοδοχείου με κάψουλες, ο αερισμός δεν είναι εύκολος, γεγονός που μπορεί εύκολα να οδηγήσει σε μείωση της ποιότητας του αέρα, γεγονός που αυξάνει την ασφάλεια της ζωής και τους κινδύνους για την υγεία των επιβατών.
2. Ζητήματα απορρήτου: Δεδομένου ότι το ξενοδοχείο είναι ανά άτομο, ενδέχεται να προκύψουν ζητήματα ασφάλειας και απορρήτου.
3. Εγκαταστάσεις και εξοπλισμός: Η χρήση των ξενοδοχείων με κάψουλες είναι πολύ μικρή και προκειμένου να μειωθεί ο χώρος, ορισμένες εγκαταστάσεις και εξοπλισμός είναι πολύ απλοποιημένες, γεγονός που μπορεί να μην ανταποκρίνεται στις ανάγκες των ταξιδιωτών.
